1) オープニング

2) メインタイトル

3) U.F.O.襲来

4) ラゴス島の回想

5) 未確認飛行物体

6) 恐竜の写真

7) 自衛隊出動

8) 3次元立体映像1

9) 3次元立体映像2

10) テレポーテーション

11) 未来からの提案

12) MOTHER

13) ドラット

14) ラゴス島守備隊

15) 守備隊突撃

16) ゴジラザウルス

17) ゴジラザウルス復活

18) 恐竜との別れ

19) ラゴス島のドラット

20) キングギドラの影

21) キングギドラ福岡襲撃

22) 寺沢とエミー

23) ベーリング海・海底

24) アンドロイドM-11

25) 巨大な水柱

26) ゴジラ出現

27) ゴジラ北海道上陸

28) キングギドラ墜落

29) キングギドラ首切断

30) ゴジラの勝利

31) 札幌時計台

32) メカ・キングギドラ登場

33) さよなら私の故郷

34) エンディング素材1

35) エンディング素材2

36) メインタイトル

37) メカ・キングギドラ登場

38) キングギドラ追撃せよ

39) ローリングタイトル