1) プロローグ〜ノアズ・アークのテーマ

2) ヒロキの決断〜出航

3) 名探偵コナン メイン・テーマ(ベイカー街ヴァージョン)

4) ゲームショー

5) 二世・三世の子供達

6) 無礼な奴ら

7) コクーン

8) 阿笠博士のクイズ

9) 父への思い

10) シンドラーのサスペンス

11) 事件現場〜コナンの推理

12) ダイイング・メッセージ

13) ノアズ・アーク悪のテーマ

14) ゲームの説明

15) ゲームのコース紹介

16) いよいよゲームステージへ

17) ヒロキの生い立ち

18) ジャック・ザ・リッパー?

19) 不安な面持ち

20) 元気をだして〜時計の針が…

21) ホームズの部屋

22) ジャック・ザ・リッパーの考察

23) モラン大佐の所へ〜潜入

24) 迫りくる悪

25) コナン一同の危機

26) 万事休す〜コナンの賭け

27) モリアーティ教授の元へ

28) ジャック・ザ・リッパーの生い立ち

29) 夜のロンドン〜第二の犯行現場

30) モリアーティの広告

31) 美しいアイリーン・アドラー

32) オペラ劇場が〜恐怖

33) 追跡〜チャリング・クロス駅

34) 犯人はお前だ!

35) 犯人の正体

36) 優作の推理

37) 囚われの身の蘭

38) ジャック・ザ・リッパーの因縁

39) 追いつめられるコナン

40) 蘭の勇気

41) 静寂〜ありがとうホームズ

42) ヒロキのテーマ(ノアズ・アーク)

43) 生還

44) コナンのゲームオーバー

45) ありがとうホームズ(Long Version)